1、自身免疫性甲状腺炎
自身免疫性甲状腺炎通常发生在青少年中，甚至在儿童中也很普遍，这是儿童常见的甲状腺疾病。自身免疫性甲状腺炎可以是甲状腺功能减退，也可以甲状腺功能亢进，基因和环境因素会导致儿童患病。
2、乳糜泻
有乳糜泻的宝贝如果吃了小麦、大麦、黑麦等食物和含有蛋白质麸质的熟食，则这种消化系统疾病会被触发。
3、牛皮癣
牛皮癣可能是由于自身免疫性疾病或皮肤上的细菌感染所致，儿童可能会通过遗传或其他自身免疫性疾病，例如1型糖尿病和类风湿关节炎而患上这种疾病，这种疾病会引起皮肤瘙痒。
4、自身免疫性肝炎
自身免疫性肝炎是一种发炎性疾病，会损害肝脏并导致肝硬化，通常会影响两岁到十几岁的女孩。
5、过敏性紫癜
在受过敏性紫癜影响的儿童中，发炎的皮肤会渗出红细胞，导致腿、臀部和手臂出疹子。男孩比女孩更容易得过敏性紫癜，这种自身免疫性皮疹可在2至11岁之间的宝贝发展。
6、小儿风湿病
小儿风湿病可影响16岁以下的儿童，小儿风湿病是儿童各种风湿病的统称，影响从肌肉骨骼系统到眼睛、皮肤、肌肉和胃肠道的不同身体部位。
7、皮肌炎
青少年的皮肌炎是一种肌肉发炎，该疾病是因为免疫系统的缺陷会攻击整个宝贝体内的血细胞。这种情况非常罕见，主要发生在五到十岁的儿童中。
8、硬皮病
这种自身免疫性疾病是由于胶原蛋白的过量产生，而形成了厚厚的皮肤斑块。有两种类型，局部性硬皮病仅影响皮肤，全身性硬皮病，除了皮肤外还影响肾脏、心脏和胃肠道等内脏器官。
9、青少年1型糖尿病
胰腺停止产生胰岛素激素，从而导致1型糖尿病。该疾病可在任何年龄发展，但在20岁以下的人群中更为普遍。
10、小儿狼疮
系统性红斑狼疮或其他的红斑狼疮会损害皮肤、肾脏、心脏、肺、血管和大脑等器官，该疾病在5岁以下的儿童中很少见，但小于18岁的青少年也有很多病例。
11、川崎病
这种罕见的疾病是由于身体肌肉发炎而发生的，如果不加以治疗，可能会影响心脏的冠状血管。川崎病的症状包括发烧、皮疹和颈部淋巴结肿大，会持续好几天。
目前尚未了解这些免疫疾病和病症的确切原因。由于很多症状并非自身免疫性疾病所独有，因此对医生而言，诊断是一项挑战。自身免疫性疾病无法治愈，但是可以减轻症状，控制自身免疫所造成的损害，维持人体抵抗疾病的能力。